Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms