Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms