Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHCHD7Q9BUK0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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