Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THUMPD2Q9BTF0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THUMPD2Q9BTF0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms