Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UPK3BQ9BT76 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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UPK3BQ9BT76 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
UPK3BQ9BT76 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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