Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM79Q9BSE2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM79Q9BSE2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms