Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC22CQ9BRL7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms