Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LPIN3Q9BQK8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LPIN3Q9BQK8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms