Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CITED2Q99967 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms