Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms