Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAT1Q99536 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VAT1Q99536 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms