Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EYA3Q99504 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms