Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED4Q96RK1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms