Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HHIPQ96QV1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHIPQ96QV1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms