Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF12Q96QT6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms