Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85AQ96PX6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms