Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC2Q96PR1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC2Q96PR1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms