Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK3Q96PN8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms