Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC43Q96MW1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms