Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CFAP53Q96M91 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms