Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

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Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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