Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
LRRIQ1Q96JM4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
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