Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4CQ96DT6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms