Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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FAM3DQ96BQ1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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FAM3DQ96BQ1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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FAM3DQ96BQ1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FAM3DQ96BQ1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FAM3DQ96BQ1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM3DQ96BQ1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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