Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms