Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RNF34Q969K3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF34Q969K3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms