Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT35Q92764 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms