Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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