Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RUFY2Q8WXA3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms