Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PALLDQ8WX93 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALLDQ8WX93 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms