Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KBTBD3Q8NAB2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KBTBD3Q8NAB2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms