Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNBD1Q8NA66 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNBD1Q8NA66 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms