Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC82Q8N4S0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms