Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCL2Q8N4E4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCL2Q8N4E4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms