Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LMNTD2Q8IXW0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms