Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHA9Q7RTU4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms