Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP1Q7RTM1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP1Q7RTM1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms