Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC80Q76M96 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms