Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP43Q70EL4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms