Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM72Q6ZMU5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM72Q6ZMU5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms