Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L3Q6VB84 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms