Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL35Q6PF15 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms