Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms