Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGMBQ6NW40 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms