Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSAPQ6IQ19 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms