Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1DP3Q658K8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1DP3Q658K8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1DP3Q658K8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1DP3Q658K8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms