Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1QL3Q5VWW1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms