Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms