Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GARNL3Q5VVW2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GARNL3Q5VVW2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms