Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF20Q5VTR2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms